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定量蛋白組學分析

定量蛋白組學分析

標記定量
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標記定量基本原理利用不同穩定同位素標記不同樣品中的肽段,等量混合后質譜檢測。通過比較不同穩定同位素標記肽段間的質量差對不同樣品中的肽段及蛋白進行相對定量。 技術路線結果示例差異蛋白篩選基于不同篩選標準,篩選樣品間定量差異顯著的蛋白。統計各比較組間差異蛋白總數及不同顯著性的差異蛋白數量。差異蛋白列表展示篩選出的差異蛋白定量比值及其差異顯著性聚類分析熱圖及趨勢圖展示差異蛋白聚類熱圖及各類別蛋白定量趨勢。注釋及富集分析展示差異蛋白注釋信息及其中顯著富集的注釋條目。 蛋白互作網絡展示差異蛋白間已知及推測存在的蛋白相互作用適用項目差異蛋白篩選病毒宿主相互作用疾病標志物篩選生理病理機制探索激酶底物篩選鑒定
SWATH定量
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SWATH定量基本原理通過傳統DDA質譜檢測模式建立譜圖數據庫后,采用SWATH質譜檢測模式,全面提取二級譜圖中的碎片離子定量信息,對各個鑒定到的肽段及蛋白進行相對定量。技術路線???結果示例定量數據總覽展示所有定量蛋白的定量信息熱圖???差異蛋白篩選基于不同篩選標準,篩選樣品間定量差異顯著的蛋白。???差異蛋白統計概覽統計各比較組間差異蛋白總數及不同顯著性的差異蛋白數量。???差異蛋白列表展示篩選出的差異蛋白定量比值及其差異顯著性???聚類分析熱圖及趨勢圖展示差異蛋白聚類熱圖及各類別蛋白定量趨勢。??注釋及富集分析展示差異蛋白注釋信息及其中顯著富集的注釋條目。???蛋白互作網絡展示差異蛋白間已知及推測存在的蛋白相互作用??適用項目差異蛋白篩選疾病生物標志物篩選
非標記定量
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非標記定量基本原理基于各肽段一級譜圖的檢測信號強度,歸一化處理后對其對應蛋白進行相對定量。技術路線??結果示例定量數據總覽展示所有定量蛋白的定量信息熱圖??差異蛋白篩選基于不同篩選標準,篩選樣品間定量差異顯著的蛋白。??差異蛋白統計概覽統計各比較組間差異蛋白總數及不同顯著性的差異蛋白數量。??差異蛋白列表展示篩選出的差異蛋白定量比值及其差異顯著性聚類分析熱圖及趨勢圖展示差異蛋白聚類熱圖及各類別蛋白定量趨勢。??注釋及富集分析展示差異蛋白注釋信息及其中顯著富集的注釋條目。??蛋白互作網絡展示差異蛋白間已知及推測存在的蛋白相互作用??適用項目差異蛋白篩選互作蛋白篩選病毒與宿主相互作用疾病生物標志物篩選生理病理機制探索
PRM靶向定量
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PRM靶向定量基本原理通過傳統DDA質譜檢測模式,選定目標蛋白特定的靶標離子,通過PRM靶向檢測選定的靶標離子,從而對目標蛋白進行精確定量。技術路線??結果示例適用項目蛋白絕對定量質譜定量數據驗證
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蛋白質組學

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